Trung tâm này đã tiến hành khai quật 6 hố tại vùng lõi Khu di tích Bến Đình và phát hiện các nền móng của kiến trúc đền tháp cổ, trong đó có dấu tích của nhà dài, các dấu vết sinh hoạt, kiến trúc của nhà sập giữ nguyên trên bề mặt cùng những mảnh gốm vỡ, gạch nung, nền đá, nhiều vật thể khai quật được còn hiện rõ các chi tiết hoa văn cầu kỳ, tỉ mỉ với niên đại thế kỷ 8 - 9, thuộc giai đoạn hậu Óc Eo cách đây hơn 1.000 năm.
Theo lãnh đạo Sở VH-TT-DL tỉnh Tây Ninh, đây là các công trình kiến trúc cổ độc đáo, rất có giá trị về nghiên cứu khảo cổ.